Maize
Studies: 11
CIMMYT Maize Line (CML) SNPs Generated Using DArTseq Genotypingby Hearne, Sarah; Chen, Jiafa; Petroli, Cesar; Kilian, Andrzej
Abstract:

This set of genotypic data was used for the analyses described in the paper:
Chen J, Zavala C, Ortega N, Petroli C, Franco J, Burgueño J, et al. (2016) The Development of Quality Control Genotyping Approaches: A Case Study Using Elite Maize Lines. PLoS ONE 11(6): e0157236. doi:10.1371/journal.pone.0157236

hdl:11529/10431
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Last Released: Mar 1, 2017
Abstract:

En un análisis efectuado a aproximadamente 1,200 accesiones de maíz nativo colectadas en un proyecto financiado por CONABIO (Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad) en México, no se encontró evidencia de materiales genéticamente modificados. Los investigadores del CNRG trataron de amplificar el promotor 35S utilizado comúnmente en la modificación genética de maíz y no encontraron evidencia de este evento en ninguna de las muestras estudiadas.
En los archivos "Registro de Colecta", el número que se encuentra en la columna denominada "Material", corresponde a la ID (identificación individual de cada colecta) definida en la primera columna de la base de datos del proyecto global de maíces nativos de la CONABIO, la cual está disponible en formatos .mdb y .xls en la Liga http://www.biodiversidad.gob.mx/genes/proyectoMaices.html.

An analysis of approximately 1200 maize landraces collected under a CONABIO funded project in the 2000’s in Mexico did not find any evidence of genetically modified materials. Researchers at CNRG attempted to amplify the 35S promoter commonly used in the genetic modification of corn and did not find any evidence of this event in any of the samples tested.
In the “Registro de Colecta” files, the number in the column called “Material” corresponds with the collection ID defined in the first column of the database of the CONABIO Proyecto global de maíces nativos; “Base Maices nativos”, which is available in .mdb and .xls format from http://www.biodiversidad.gob.mx/genes/proyectoMaices.html.

hdl:11529/10707
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Last Released: Sep 9, 2016
Evaluation of Adaptation to Low Soil Nitrogen Levels in 2012 in El Batán, Méxicoby Willcox, Martha; Guadarrama Espinoza, Armando; Chepetla Calderon, Daniel; Rodriguez Chanona, Enrique; Burgueño, Juan
Abstract:

Testcrosses generated using highland accessions from the CIMMYT Maize Germplasm Bank were evaluated in soils with low and optimal levels of nitrogen. The raw, uncurated data are presented in this study.

hdl:11529/10531
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Last Released: Nov 27, 2015
Evaluation of maize landraces for drought tolerance in 2014by Molnar, Terence; Willcox, Martha; Burgueño, Juan; Montiel Gomez, Noel O.; Sifuentes, M.C. Ernesto; Vidal, Victor A.
hdl:11529/10832
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Last Released: Dec 31, 2016
Evaluation of Tar Spot Resistance in 2011 in Guadalupe-Victoria, Chiapasby Willcox, Martha; Burgueño, Juan ; Mahuku, George ; Guadarrama Espinoza, Armando ; Chepetla Calderon, Daniel ; Lopez, Manuel ; Gonzalez, Jesus ; Leyva, Mayolo ; San Vicente, Felix ; Maize Germplasm Bank; Dupont Pioneer
hdl:11529/10031
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Last Released: Nov 16, 2015
hdl:11529/10846
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Last Released: Dec 31, 2016
Imputed GbS derived SNPs for maize landrace accessions represented in the SeeD-maize GWAS panel: Imputation using Beagle v.4by Hearne, Sarah; Chen, Charles; Buckler, Ed; Mitchell, Sharon; Romero, Alberto; Swarts, Kelly; Li, Huihui
Abstract:

Obtain imputed SNP profiles using Beagle v.4 from genotyping-by-sequencing of the accession parents of the SeeD GWAS testcross panel.

hdl:11529/10035
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Last Released: Mar 23, 2017
Imputed GbS derived SNPs for maize landrace accessions represented in the SeeD-maize GWAS panel: Imputation using FILLINby Hearne, Sarah; Buckler, Ed; Chen, Charles; Mitchell, Sharon; Swarts, Kelly; Li, Huihui; Romero, Alberto
Abstract:

Obtain imputed SNP profiles from genotyping-by-sequencing of the accession parents of the SeeD GWAS testcross panel.

hdl:11529/10036
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Last Released: Mar 23, 2017
Maize Grain Quality Analysis for SeeD-MAB GWAS Testcross Panel Materials: 2011-2012by Palacios, Natalia; Willcox, Martha; Guadarrama Espinoza, Armando ; Rodriguez Chanona, Enrique; Preciado, Ernesto; Terrón, Arturo
Abstract:

Testcrosses generated using accessions from the CIMMYT Maize Germplasm Bank were evaluated for several quality parameters including oil, protein, and starch content, grain color, and carotenoid levels. All seed used in these analyses were generated through hand pollination in Agua Fria, México in the winter of 2012 or in El Batán, México in summer of 2012 and analyzed in the Maize Nutritional Quality and Vegetative Tissue Analysis Laboratory at CIMMYT. The raw, uncurated data are presented in this study.

hdl:11529/10579
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Last Released: Dec 20, 2015
Abstract:

El proyecto de SeeD (MasAgro - Biodiversidad) tiene como propósito el mayor aprovechamiento de recursos genéticos valiosos mediante tecnologías de punta y desarrollo de capacidades, para acelerar el desarrollo de variedades de maíz y trigo de alto rendimiento, estables y tolerantes al cambio climático. Uno de sus objetivos especificos busca el fortalecimiento de capacidades de los investigadores que contribuyen al fitomejoramiento. Para lograr lo anterior se ofrecen cursos y talleres a actores clave de las redes de mejoramiento de maíz y trigo. En el período del 18 al 21 de agosto de 2015, se desarrolló el taller titulado "Análisis de Estudios de Genoma Completo e Introducción a la Predicción Genómica para el Mejoramiento de Maíz y Trigo" en la sede principal del CIMMYT. Este taller tuvo como propósito de aprendizaje el siguiente: Al final del taller, los participantes serán capaces de realizar análisis de asociación de genoma completo, así como diseño de experimentos para evaluar fenotipos de interés, mediante la aplicación de estos métodos.

hdl:11529/10294
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Last Released: Mar 31, 2017